在醫(yī)改資金投入和使用情況的審計(jì)過程中，注冊(cè)會(huì)計(jì)師應(yīng)重點(diǎn)關(guān)注以下問題：
（一）政府舉辦的基層醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)的基本建設(shè)和設(shè)備購(gòu)置等發(fā)展建設(shè)支出的政府補(bǔ)助資金使用情況。
（二）政府舉辦的基層醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)的經(jīng)常性收入、經(jīng)常性支出的核定情況，以及政府核定的差額補(bǔ)助資金的使用情況。
（三）政府對(duì)包括公立醫(yī)院在內(nèi)的各類醫(yī)療機(jī)構(gòu)承擔(dān)的公共衛(wèi)生任務(wù)、公立醫(yī)院重點(diǎn)學(xué)科建設(shè)項(xiàng)目所給予的專項(xiàng)補(bǔ)助資金的使用情況，以及政府購(gòu)買醫(yī)療服務(wù)成本的核定情況。
（四）專業(yè)公共衛(wèi)生服務(wù)機(jī)構(gòu)以及實(shí)行收支兩條線管理的基層醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)按照規(guī)定取得的收入，上繳國(guó)庫(kù)或財(cái)政專戶管理的情況。
三、大力支持公立醫(yī)院改制重組和醫(yī)藥企業(yè)收購(gòu)整合
《意見》明確提出，鼓勵(lì)和引導(dǎo)社會(huì)資本發(fā)展醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)。其中包括，積極引導(dǎo)社會(huì)資本以多種方式參與包括國(guó)有企業(yè)所辦醫(yī)院在內(nèi)的部分公立醫(yī)院改制重組，鼓勵(lì)社會(huì)資本依法興辦非營(yíng)利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)，等等。
投資主體多元化、投資方式多樣化辦醫(yī)體制的逐步形成，公立醫(yī)院的改制重組將日益增多，藥品生產(chǎn)流通企業(yè)的收購(gòu)整合也將不斷涌現(xiàn)。注冊(cè)會(huì)計(jì)師應(yīng)當(dāng)充分利用在企業(yè)改制、重組、并購(gòu)等專項(xiàng)服務(wù)中形成的專業(yè)優(yōu)勢(shì)和積累的豐富經(jīng)驗(yàn)，為公立醫(yī)院改制重組和醫(yī)藥企業(yè)收購(gòu)整合，提供高質(zhì)量的審計(jì)和咨詢等服務(wù)。
此外，適應(yīng)各類投資主體的不同特點(diǎn)和需求，注冊(cè)會(huì)計(jì)師應(yīng)當(dāng)積極為醫(yī)療機(jī)構(gòu)內(nèi)部控制制度的設(shè)計(jì)、成本費(fèi)用的控制、管理流程的規(guī)范等提供專業(yè)服務(wù)，并積極承辦代編財(cái)務(wù)信息和稅務(wù)代理等咨詢服務(wù)，幫助醫(yī)療機(jī)構(gòu)提高財(cái)務(wù)信息質(zhì)量和綜合管理水平。
四、扎實(shí)做好醫(yī)院財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)工作
加強(qiáng)醫(yī)院財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)工作，對(duì)于嚴(yán)格醫(yī)院內(nèi)部控制制度，強(qiáng)化醫(yī)院外部監(jiān)督約束機(jī)制，提升醫(yī)院經(jīng)營(yíng)管理水平具有重要作用。在開展醫(yī)院財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)工作中，注冊(cè)會(huì)計(jì)師應(yīng)當(dāng)充分把握醫(yī)院的業(yè)務(wù)特性和流程特點(diǎn)，重點(diǎn)關(guān)注以下方面：
（一）大型公立醫(yī)院運(yùn)行的信息化程度相對(duì)較高，信息系統(tǒng)的使用情況在很大程度上影響著財(cái)務(wù)報(bào)表的質(zhì)量。因而，應(yīng)對(duì)醫(yī)院信息系統(tǒng)設(shè)計(jì)的合理性、運(yùn)行的有效性進(jìn)行重點(diǎn)測(cè)試。
（二）醫(yī)院固定資產(chǎn)數(shù)量多、管理難度大，應(yīng)當(dāng)實(shí)施更為有效的實(shí)質(zhì)性程序，對(duì)醫(yī)院固定資產(chǎn)的存在性、價(jià)值的準(zhǔn)確性、資本化與費(fèi)用化劃分的合理性、資本支出的合規(guī)性及真實(shí)性等進(jìn)行重點(diǎn)驗(yàn)證。
（三）醫(yī)院收入的項(xiàng)目多、來(lái)源廣、形式多樣，應(yīng)重點(diǎn)審計(jì)醫(yī)院收入發(fā)生的真實(shí)性、確認(rèn)的完整性、截止的正確性，以及藥品加成政策的執(zhí)行情況。同時(shí)，關(guān)注收費(fèi)環(huán)節(jié)可能發(fā)生的錯(cuò)報(bào)，控制錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)。