第三、在改制過程中切實(shí)注意保護(hù)職工的合法權(quán)益，對涉及職工切身利益的決定應(yīng)交由工會(huì)和職工大會(huì)討論并形成決議。
　　三、根據(jù)單位不同情況決定企業(yè)形式
　　由于事業(yè)單位具有分布較廣、類型復(fù)雜等特點(diǎn)，在轉(zhuǎn)制、改制過程中不能就改制單位的形態(tài)進(jìn)行“一刀切”，而是要根據(jù)各個(gè)單位的不同特點(diǎn)來決定其改制的形式;從改制單位的股權(quán)設(shè)置角度來說，也不能片面強(qiáng)調(diào)國有資本全部退出，而要根據(jù)各單位的不同情況，在鼓勵(lì)經(jīng)營者持大股的前提下，有選擇的保留部分國有股份。
　　根據(jù)大多數(shù)事業(yè)單位的實(shí)際情況，按照現(xiàn)代企業(yè)制度的要求，改制為有限責(zé)任公司是一種常見的做法。有限責(zé)任公司具有注冊資本要求較低、設(shè)立程序簡單、出資方式靈活、治理結(jié)構(gòu)設(shè)置靈活、改制成本低等特點(diǎn)，比較適合于那些參股人數(shù)較少、企業(yè)資產(chǎn)不是很多的企業(yè)。改制成有限責(zé)任公司可以從產(chǎn)權(quán)制度改革上一步到位，有利于企業(yè)的經(jīng)營層、主要經(jīng)營者和業(yè)務(wù)骨干持大股。
　　股份合作制企業(yè)是我國由計(jì)劃經(jīng)濟(jì)向市場經(jīng)濟(jì)轉(zhuǎn)軌過程中發(fā)展出來的、獨(dú)具中國特色的企業(yè)組織形式。這種組織形式在歷史上具有積極的意義，但總的來說，仍然是向現(xiàn)代企業(yè)制度過渡的一種中間形態(tài)。隨著社會(huì)主義市場經(jīng)濟(jì)的發(fā)展和企業(yè)規(guī)模的壯大，目前許多股份合作制企業(yè)正走向規(guī)范的股份制。因此，我們認(rèn)為，除了對那些職工入股愿望強(qiáng)烈、人數(shù)較多的單位外，一般不宜再采用這類組織形式。
　　對于那些資產(chǎn)規(guī)模大、經(jīng)濟(jì)效益好的單位，股份有限公司則是最佳的選擇。在設(shè)立股份有限公司時(shí)，我們認(rèn)為有必要保留部分國有股份，同時(shí)也應(yīng)積極吸收社會(huì)上的各種投資基金的介入。這樣，既能有效地保證國有資產(chǎn)的保值和增值，也能更深地加強(qiáng)企業(yè)同資本市場的聯(lián)系，使企業(yè)具有更強(qiáng)的生命力。
　　四、建立完善的企業(yè)治理結(jié)構(gòu)
　　此次事業(yè)單位改制的總體目標(biāo)是建立真正自主經(jīng)營、自負(fù)盈虧、自我發(fā)展、自我約束的獨(dú)立的企業(yè)法人實(shí)體，那么在改制過程中就應(yīng)該按照現(xiàn)代企業(yè)制度的要求來完善企業(yè)的治理結(jié)構(gòu)，保證企業(yè)未來的正常運(yùn)轉(zhuǎn)。
　　在現(xiàn)代企業(yè)制度中，股東會(huì)、董事會(huì)、監(jiān)事會(huì)、經(jīng)理層各司其職、各行其權(quán)。然而，我國的國有企業(yè)中普通存在的嚴(yán)重“內(nèi)部人控制”、國有股權(quán)代表人缺位、董事會(huì)與監(jiān)事會(huì)監(jiān)督功能弱化等問題，往往容易導(dǎo)致國有資產(chǎn)的流失。因此本次事業(yè)單位改制，在改制企業(yè)的公司治理結(jié)構(gòu)的設(shè)置上應(yīng)注意以下幾點(diǎn)：
　　第一、依法建立完善的股東會(huì)、董事會(huì)、監(jiān)事會(huì)，制訂具有明確可操作性的企業(yè)章程和議事規(guī)則。這首先從制度上構(gòu)成了公司治理結(jié)構(gòu)得以順利運(yùn)行的保證。