主管研發(fā)機(jī)構(gòu)退稅的國(guó)家稅務(wù)局負(fù)責(zé)研發(fā)機(jī)構(gòu)采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅的認(rèn)定、審核審批及監(jiān)管工作。

采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備適用退還增值稅政策的研發(fā)機(jī)構(gòu)范圍和設(shè)備清單范圍，按財(cái)稅[2009]115號(hào)文件相關(guān)規(guī)定執(zhí)行。

享受采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅的研發(fā)機(jī)構(gòu)，應(yīng)在申請(qǐng)辦理退稅前持以下資料向主管退稅稅務(wù)機(jī)關(guān)申請(qǐng)辦理采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備的退稅認(rèn)定手續(xù)。

　?。ㄒ唬┢髽I(yè)法人營(yíng)業(yè)執(zhí)照副本或組織機(jī)構(gòu)代碼證（原件及復(fù)印件）；

　?。ǘ┒悇?wù)登記證副本（原件及復(fù)印件）；

　　（三）退稅賬戶證明；

　?。ㄋ模┒悇?wù)機(jī)關(guān)要求提供的其他資料。

　　本辦法下發(fā)前已辦理出口退稅認(rèn)定手續(xù)的，不再辦理采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備的退稅認(rèn)定手續(xù)。

研發(fā)機(jī)構(gòu)發(fā)生解散、破產(chǎn)、撤銷以及其他依法應(yīng)終止采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅事項(xiàng)的，應(yīng)持相關(guān)證件、資料向其主管退稅稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理注銷認(rèn)定手續(xù)。已辦理采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅認(rèn)定的研發(fā)機(jī)構(gòu)，其認(rèn)定內(nèi)容發(fā)生變化的，須自有關(guān)管理機(jī)關(guān)批準(zhǔn)變更之日起30日內(nèi)，持相關(guān)證件、資料向其主管退稅稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理變更認(rèn)定手續(xù)。

　　屬于增值稅一般納稅人的研發(fā)機(jī)構(gòu)購(gòu)進(jìn)國(guó)產(chǎn)設(shè)備取得的增值稅專用發(fā)票，應(yīng)在規(guī)定的認(rèn)證期限內(nèi)辦理認(rèn)證手續(xù)。2009年12月31日前開具的增值稅專用發(fā)票，其認(rèn)證期限為90日；2010年1月1日后開具的增值稅專用發(fā)票，其認(rèn)證期限為180日。未認(rèn)證或認(rèn)證未通過的一律不得申報(bào)退稅。

研發(fā)機(jī)構(gòu)應(yīng)自購(gòu)買國(guó)產(chǎn)設(shè)備取得的增值稅專用發(fā)票開票之日起180日內(nèi)，向其主管退稅稅務(wù)機(jī)關(guān)報(bào)送《研發(fā)機(jī)構(gòu)采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅申報(bào)審核審批表》（見附件）及電子數(shù)據(jù)申請(qǐng)退稅，同時(shí)附送以下資料：

　　（一）采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備合同；

　?。ǘ┰鲋刀悓Ｓ冒l(fā)票（抵扣聯(lián)）；

　　（三）付款憑證；

　?。ㄋ模┒悇?wù)機(jī)關(guān)要求提供的其他資料。

不屬于獨(dú)立法人的公司內(nèi)設(shè)部門或分公司的外資研發(fā)中心采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備，由總公司向其主管退稅稅務(wù)機(jī)關(guān)申請(qǐng)退稅。

主管退稅稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)已辦理退稅的增值稅專用發(fā)票應(yīng)加蓋“已申報(bào)退稅”章，留存或退還企業(yè)并按規(guī)定保存，企業(yè)不得再作為進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣憑證。

　　研發(fā)機(jī)構(gòu)已退稅的國(guó)產(chǎn)設(shè)備，由主管退稅稅務(wù)機(jī)關(guān)進(jìn)行監(jiān)管，監(jiān)管期為5年。監(jiān)管期內(nèi)發(fā)生設(shè)備所有權(quán)轉(zhuǎn)移行為或移作他用等行為的，研發(fā)機(jī)構(gòu)須按以下計(jì)算公式，向主管退稅稅務(wù)機(jī)關(guān)補(bǔ)繳已退稅款。

　　應(yīng)補(bǔ)稅款=增值稅專用發(fā)票上注明的金額×（設(shè)備折余價(jià)值÷設(shè)備原值）×適用增值稅稅率

　　設(shè)備折余價(jià)值=設(shè)備原值-累計(jì)已提折舊

　　設(shè)備原值和已提折舊按企業(yè)會(huì)計(jì)核算數(shù)據(jù)計(jì)算。