（二）內(nèi)部審計機構(gòu)缺乏應有的獨立性
　　內(nèi)部審計機構(gòu)是企業(yè)的內(nèi)設機構(gòu)，其獨立性不如外部審計，在審計過程中，不可避免地受到企業(yè)管理層意志的影響。目前，由于很多企業(yè)的內(nèi)審機構(gòu)并非直接向董事會負責，而是向總經(jīng)理負責，或者在財務總監(jiān)的領導下工作，甚至有的企業(yè)內(nèi)審機構(gòu)從屬于財務部門，這種機構(gòu)設置使內(nèi)部審計工作的獨立性和客觀性受到影響，很難以窄觀、公允的立場對企業(yè)的財務狀況和經(jīng)營管理進行有效的監(jiān)督和評價，提供出真實客觀程度較高的且富有建設性意見的審計報告。
　　（三）企業(yè)管理人員對內(nèi)部審計不夠重視
　　內(nèi)部審計產(chǎn)生的內(nèi)在動因是基于管理和監(jiān)控的需要，有些企業(yè)設立內(nèi)部審計機構(gòu)卻是迫于行政命令的規(guī)定，而非出于自身經(jīng)營管理的需要；有些企業(yè)管理層不明白內(nèi)部審計的真正意義，沒有意識到內(nèi)部審計對企業(yè)內(nèi)部控制實施、監(jiān)督和評價的重要作用，將內(nèi)部審計放在可有可無位置，沒有把它有機地融人到企業(yè)的管理體系中，使其真正擔負起管理、監(jiān)控的雙重責任，內(nèi)部審計機構(gòu)設置流于形式，內(nèi)部審計人員地位邊緣化，在企業(yè)管理活動中不受重視，這些都會影響內(nèi)部審計工作的運行環(huán)境，使內(nèi)部審計風險加大。
　?。ㄋ模┢髽I(yè)經(jīng)濟活動的復雜性和隱蔽性
　　隨著現(xiàn)代經(jīng)濟的發(fā)展，企業(yè)的經(jīng)濟活動形式越來越多樣化，相應內(nèi)部審計對象和內(nèi)容也日益繁雜，內(nèi)部審計業(yè)務范圍從傳統(tǒng)的財務會計審計向經(jīng)濟管理審計拓展，凡是對企業(yè)商業(yè)利益和持續(xù)經(jīng)營有影響的管理因素都是內(nèi)部管理審計的重要內(nèi)容，審計領域的擴大對內(nèi)部審計工作提出了更高的要求，審計人員做出正確結(jié)論的難度加大；同時，由于內(nèi)部審計事項一般與企業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營活動密切相關，一些敏感事項涉及的人事關系復雜、舞弊手段隱蔽，內(nèi)部審計人員發(fā)現(xiàn)和取證的難度較大，面臨更大的責任和風險；另外，隨著信息化程度的提高，企業(yè)會計信息資料和其他經(jīng)營管理信息越來越多，形式種類也越來越豐富，同時與之相隨的虛假、差錯的會計和其他管理信息出現(xiàn)頻率也越來越高。各種復雜的經(jīng)濟活動不但擴大了內(nèi)部審計的范圍和工作量，而且給建立在傳統(tǒng)審計理論基礎上的內(nèi)部審計方法和程序帶來了巨大的沖擊，這無形中就增加了內(nèi)部審計的責任和風險。
（五）內(nèi)部審計人員的整體素質(zhì)不高
　　現(xiàn)代內(nèi)部審計是一項涉及面非常廣泛的專業(yè)活動，不僅要求內(nèi)審人員必須具備豐富的專業(yè)知識，包括會計、審計、經(jīng)濟管理、定量分析、內(nèi)部控制的檢查和評價、電子數(shù)據(jù)處理等方面的知識，還要求其必須擁有豐富的實踐經(jīng)驗，具有敏銳的分析能力和較高的職業(yè)判斷能力，此外內(nèi)部審計人員還必須具備工作責任心和職業(yè)道德意識，審計人員素質(zhì)的高低是決定審計風險大小的主觀因素。目前，由于內(nèi)部審計機構(gòu)和審計人員普遍未受重視，同時我國內(nèi)審準則、工作規(guī)范和職業(yè)道德標準仍存在相對滯后現(xiàn)象，許多內(nèi)審機構(gòu)和人員不能適應新形勢下的內(nèi)部審計發(fā)展要求，也缺乏應有的職業(yè)規(guī)范的約束和指導，內(nèi)審人員自身素質(zhì)的缺陷增加了審計風險。